《海商王3》游戏的背景设置在15世纪的加勒比公海海域，玩家将扮演一位年轻的船长，至于到底要成为英国、法国、荷兰和西班牙四国海军竞争殖民地时期的英勇的船长、凶残的海盗还是精明的商人则完全由玩家自己决定。