《火影忍者RPG2:千鸟vs螺旋丸》游戏是一款角色扮演类游戏。本作作为一款普通的RPG游戏,也还有不少新要素加入。首先是忍术战斗系统,这是一个强调阵型的战斗系统,而调整阵型可以使用触摸很轻松地即时实现。角色的配置,会对忍术攻防能力的高低产生重大的影响。三人组系统,可供选择的角色也大幅度增加,所产生的组合数超过了1000种。口寄动物召唤系统,可以带着口寄动物行走,他们拥有的能力对冒险历程将产生巨大的帮助,例如带着蛤蟆吉的话,就拥有能跳过高墙的异常跳跃力,在旧有的基础上再次进化,满足条件即可发动,对敌人造成巨大伤害。本作支持2人联机游戏。