生化奇兵3号称耗资过亿的作品，所以在很多人看来，这款作品具有非常的内涵，尤其是游戏中的宗教气味比较浓烈，所以在玩这款游戏的时候要先了解一下圣经，要不然会对游戏比较难以理解。
宗教色彩解读
升到天空城的第一个场景是一首赞美，Johnny cash唱过，in the circle.... by and by, by and by，这首赞美的主题是期待天国的降临。
第一个场景一水为主题，如同圣经中约翰福音3:5节的内容“耶稣说：「我实实在在的告诉你，人若不是从水和圣灵生的，就不能进 神的国。 ” 门口那个白衣人也说了，这是在审判日之前的天国。
进门第一个场景的老人带着一群人进入，新伊甸的那个画面。
相信灵感来自于出埃及记，摩西带领以色列人进入迦南地的记录，而这里把这个带大家进入天空城的“先知”升华到了救世主的程度。
后来在所谓的“圣母”房间里面，找到的录音带的录音也是在说，“如果没有罪救世主的救赎就没有意义。。。。"。
这样的教导自然是在放纵罪，感觉一个异端，一个邪恶的势力正是他们。
后来进入到一个类似教堂的地方，那个讲道人在宣扬赞美他们先知的世纪，他们先知时如何带领他们到哥伦比亚，如何教导他们，如何牺牲了自己的最爱。（引用圣经里耶稣的职分，先知，祭司，王。分别是传讲圣道，牺牲，带领并建立。）
那个讲道人强制给主角洗礼，并且他还宣称下面的世界为所多玛和蛾摩拉（圣经中亚伯拉罕时代的罪恶城市，再多出被引用）。
他给主角洗礼了两次，这也暗示了这个异端的嘴脸。（可以参考异端anabaptist）
