《暴走皇帝》古代神秘莫测的机关术，放到今天也可以说是顶尖的技术，可惜在几千年的传承中几乎全部丢失了。不过今天，这款游戏将还原出上古机械术，不过却被反派利用。
事情是这样的，话说在《暴走皇帝》游戏中，机械术其实是一种仙术，并且只有仙人才能掌握。恰逢上古封魔大阵松动，魔神降临人间作乱，而生活在人间仙境桃花源中的一对仙人夫妇不忍人世间生灵涂炭，便运用机械术大量制造木甲人，欲用木甲人来对抗魔族大军。
然而所料未及的是，仙人夫妇在关于木甲人是否能有灵性的问题上产生了分歧，而就在夫妇两争论之时，所有木甲人却被魔族趁机同化，于是木甲人造反了，脱离了仙人的控制，霸占了机关城，奴役着机关城内的工匠继续造更多的木甲人，并谋划着统治整个世界。
幸好就在此时，玩家扮演的主角上场了，帮忙解除了仙人夫妇之间的误会，从而得到仙人夫妇的帮助，在经过惨烈的战斗之后，终于将一部分木甲人顽固分子铲除，同时也净化了大部分木甲人的魔性，一场浩劫总算被终结在萌芽之中。
