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穿过雾林之后就到达カンナギタウン(寒风镇)了,在PM中心旁边有个老奶奶,她告诉你很害怕那个挡在洞口的人,走过去一看原来是银河团的成员,击败后婆婆允许主角去洞内参观.在墙壁上就可以看见前作中的三圣菇,这时银河团的团长赤木走了过来,与他战斗(LV34 ニューラ、LV34 ゴルバット、LV36 ヤミカラス).打败赤木后老奶奶就将秘传机器03交给主角,出来后发现希罗娜也在,交谈后使用飞天,直达コトブキシティ(长寿镇).从西面出发,使用03冲浪穿越218道路来到ミァ》ティ(美央市),刚刚到达美央市没多久,在木桥上就遇见了对手,这一次他又变强了哦!胜利后休息一下就去挑战会馆吧.战胜后获得第六块徽章和技能91.出门后发现对手也在,说了几句话就走掉了.然后在上面的房子看到他,坐船前往ごうてつじま(钢铁岛)学习秘传04怪力,到了以后和洞口戴帽子的女人说话就可以获得了.
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接着坐船回去,往上走,看到对手后和他交谈,然后跟着他进图书馆去.到三楼后发现副主角和博士竟然也在,众人交谈了一下突然地震了一下,对手去查看电视,发现好像哪里爆炸了,众人立即开始行动.飞往リッジこのほとり(林事湖边),会发现原本堵在这里的两个人不见了,进去后发现到处都是鲤鱼王和银河团员的影子,进入山洞后发现里面的银河团干部,战胜后飞回老家,前往シンジこ(神事湖)为博士解围.之后再飞到ハクタイシティ(白带市),从右边出发,穿越211及这里的山洞,在山洞内往上走就可以通往216公路了.从洞口出来,看到216上白雪皑皑,已经不能使用自行车了,继续向前走,到了217公路,视线变得更加模糊了,刚走没多久后面就跟上一个人来,说完就走了.在进入217公路后会有一段区域很广的场地,先直走寻找到这里的一个小屋子,后面的道具要记得拿,是秘传机器08.到达エイチこのほとり(英知湖)时,发现对手站在一个高台上打招呼,现在的我们没有徽章是上不去的.一直往右走抵达キッサキシティ(金岬市),休息一下前往会馆挑战馆主.会馆里面白色的地板是可以站立的,其余的地方都要像滑冰一样移动,然后利用向下滑动的冲击力破坏掉阻挡在馆主前面的一排雪球就可以了(LV40 ニューラ、LV40 イノムー、LV42 ユキノオー、LV44 ユキメノコ).胜利后获得第七块徽章及技能72.
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现在开始就可以使用秘传机器08攀岩的技能了,利用它来到エイチこのほとり(英知湖),发现对手正在与银河团的成员对战,但是却败给了银河团的干部.飞到トバリシティ(户张市),往右边上面走去,爬了很高的楼梯后看到一个银河团员,和他交谈后跑掉了,这时刑警走了过来.对话后前往上次获得秘传机器02飞天的地方,刑警跟在后面跑了过来,并帮忙打开了门.进入后一直深入,从楼下到楼上再下来,回到一层的时候在出口处就可以捡到钥匙了.回到刚才的大厦,用钥匙打开门进去.来到二楼的时候发现了刑警,以及一大群的银河团团员,之后赤木就从高台上出来,并进行了演讲.结束后继续探索,在最高处遇见了赤木并进入战斗,胜利后获得大师精灵球.跟着他跑,最后在一个研究室内发现了三圣菇和银河团的研究员还有干部.和干部交谈后进入战斗,胜利后走向前启动开关,把三圣菇放走.然后前往黑金市,从207公路进入山洞,在山顶看到赤木和两个干部.打败两个干部后钻石珍珠里面的两支神兽出现,接着鬼龙登场.进入异世界后,移动操作方面会有些改变,每当你遇到三圣菇其中一只的时候,把这周围的一块石头利用怪力推下去,成功推下三个后来到底层,仔细观察会发现每只圣菇的上面或者下面都对应着一个蓝色的坑,把刚才扔下来的三个石头推进去就可以了,记住是对应的,不能是周围的.然后去和希罗娜交谈,后面出现新的道路.下去赤木对战,胜利后继续向前走,路会慢慢地出现,而鬼龙也离我们越来越近了……降服鬼龙后,飞到マサゴタウン(真砂镇)找博士,交谈之后就可以去挑战最后一个会馆了.
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飞到ノモセシティ(野茂市),从林事湖边的222号道路出发,到达ナグサシティ(名木市).刚进城就遇到了一个红头发的男人,对话后去城市右下角的了望塔楼上找馆主交谈,就可以去会馆挑战了.胜利后就可以获得最后一枚徽章和技能57.前往233号公路和一个女人交谈获得秘传机器07攀瀑,穿越233号水路后就可以到达冠军之路了,最后的精灵联盟在等待着大家.
