序幕
选好主角性别后潜入海底，照提示往左游泳通过一洞窟，(用光标指向左按着B不放游泳)来到一座拥有龙之歌秘密的巨大遗迹。随后故事回到1年前。
第一章：竜の歌
南太平洋 ガタマ環礁
在船上确定好主角名字、肤色和脸形后即可带着船长女儿一起下海。海底的珊瑚礁有几处闪光点，调查可欣赏小鱼，某处还能找个星座金币。(游戏中一共100个，具体位置看以后的介绍)和船长女儿交谈后往西南游，这里会见到条小鲸鱼，调查选择第一项去寻找它的母亲，按1键去地图打圈的地方，可开着地图游过去。见到大鲸鱼后它为保护小鲸鱼向美女冲过去，导致身上的项链掉了下去，此时调查大鲸鱼可在它背上拿到项链。发现上面刻了些小文字，任务完成，在菜单选择第2项直接返回船上。
ディープ ホール
第2天被叫醒后在船长处拿到“PULSAR”枪行海洋生物用特殊电磁治疗机械。选择ディープ ホール地点下海后会有“枪”的使用方法介绍，之后往南直游，(这里要注意氧气有限制，快没了就得回船上)通过海草区域后来到目的地发现中间有个大洞穴，游过去会发现有鲨鱼，趁它往上游时用枪攻击它的嘴部可赶跑它，之后和美女交谈时选第一项继续调查，游到海洞最深处可找到一条项链。(仔细找)之后要用枪去给那些生病的鱼治疗，鱼身上会有十字标记，不同颜色代表不同程度的症状，成功救治一定的鱼后回到船上，将2条项链选第一项组合起来，出现了关于龙之歌的迷之诗句。
上岸后来到一小岛据点，(陆地操作和海中操作差不多)给海豚取好名字可在据点到处参观下，这里可以查看各类数据收集品收集情况存档等操作，按“+”键打开据点菜单选最后一项呼出海豚，可让它进行各种表演，之后可在船长处得到“海笛”。过后去调查桌子上的无线机呼出商人可得到一些关于龙之歌的新情报，之后决定前往ヴァルカ城。可在商人处鉴定和买各种东西，还能得到它送的夜间潜水装备。(以后可以WIFI了，可以去朋友的岛屿游玩)过后调查船出航世界地图选择新地点エーゲ海 キケロス。
第二章 幻想魔城
エーゲ海 キケロス海峡
在船上可得到个探察道具。下海后往前直游不远，之后打开菜单装备船上刚得的东西，调查那块大岩石会发现一个XXXX碎片，之后往西南方向游，走不远用探察道具会发现前面有旋涡，右边沿着石壁绕去旋涡的南面，地上可捡到个东西，发现这都是以前沉船掉下的东西，继续南游会看见海底沉船，附近徘徊着很多鲨鱼，用枪赶跑他们后在船的旁边可找到一个古代腕轮，上面刻有一副图，记载着旋涡包围的村镇，继续往西南方向游，又会发现旋涡。暂时不能前进了，返回船上先去小岛据点找商人鉴定腕轮吧。
获得腕轮记载的秘密后，(晚上乘船旋涡消失)调查房子选择休息到深夜，(也可之后在船上休息)和女主角交谈可得到一些钱，(踏破海域地图的报酬)之后再次前往エーゲ海 キケロス海峡。在之前旋涡处潜下水后旋涡果然消失，往西南游不远会发现村镇的遗迹，在这里居然还见到了GG也潜在这里调查，等他走后会有食人鲨出现，用枪攻击一段时间发现无效，之后有选项出现，选择躲到井里就能避开鲨鱼的攻击了。
ヴァルカ城
在井里发现是个通道，游过去后发现是个塔构造的建筑，这里会有几个入口，进去即可来到传说中的ヴァルカ城。打开菜单装备那个水中XX，使用随便画2下点OK可把鱼都吸引过来，在迷宫般的城中游走，注意有种有刺的鱼不要靠近，游到西北处有张门下有个洞可以让女主角钻进去开门，里面是宝物库可以找到些宝物。继续前游到城右会发现墙上有副地图，旁边则到了王座处.
把右边的门开启进去，里面还有张大门被锁住，调查得到些提示什么荣光的椅子，之后回头去调查王座可找到一把荣光之键，开门进去后来到王之间，调查柜子可打开一扇暗门，同时大门会关闭，进入暗门里找到一块石板，之后回头寻找出去的方法，调查王间的桌子再调查大门，开门时需要摇晃手柄，等女主角倒数完1后再按A键才能打开门。成功后可返回船上。
回到小岛基地，在女主角处可领到一个分支任务，任务内容是去最开始的海域给鱼拍些照片就行，很简单。(会自动去目的地的，之后还可领一些分支任务，具体的以后介绍)在无线机召来商人把石板给他鉴定，提到要把石板去交给一个兽医教授去解读，之后乘船选择去水族馆。见到教授后解读需要一些时间，现在可以去北极一带调查生态。
