画面转回艾丝蒂尔这边，将调查报告交给离宫的希德之后带レン回到王都支部。众人一直在商讨工作，被冷落的レン觉得无聊就一个人跑出去玩了。发现レン不见了的艾丝蒂尔等人急忙上街去寻找。按顺序在东街区百货店（此时可以买到利贝尔通讯第5号）、历史资料馆（先上二层再下来就会发生剧情）、南街区钓公师团（需要调查鱼的拓印）、西街区咖啡店（与クニーガ对话可以得到赌博师jack5卷）、东街区冰淇淋店打听，最后得知レン在空港等着。在空港遇到送别穆拉的奥利维尔，之后レン出现。
回到协会门口，レン交给了艾丝蒂尔一封信，竟然是约修亚写来的（ED4的老套路……），于是艾丝蒂尔一个人赶往信中的约见地点格鲁纳门。在城墙上遇到了ケビン神父，他也是被一封信叫出来的（选择这是为了解决掉二人而设下的陷阱）。这时出现了和王都地下同样的人形兵器对两人进行攻击。打退它们之后回到王都，遇到了管家菲利普，得知公爵失踪了。和他一起来到支部，发现连艾南在内的众人都被催眠了，通信器也被破坏了。在楼上找到一封信，得知公爵和レン被抓走。此时阿加特和亚妮拉丝赶来。分析情况后亚妮拉丝去离宫通知军队，艾丝蒂尔三人去解救人质。
出门之后在基库的指引下赶往王都西边的港口。一进入港口就会遇到特务部队的战斗犬。消灭它们之后前进，在仓库前发生剧情，进入之后解决掉几个特务兵，得知新型导力引擎被抢走了一个。继续往港口深处走，遇到了凯诺娜和一帮特务兵挟持着公爵，而レン并不在这里。打倒特务兵之后（注意保存实力，因为接下来还有两场连续战斗，中间没有恢复和存盘机会），凯诺娜开着情报部设计的搭载新型引擎的战车出现。众人无法阻挡战车，只能跟在后面追。得知消息的尤莉亚上尉带着亲卫队员赶来试图阻止战车，但也完全不是对手。在无计可施的情况下神父使用戴尔蒙家的封印宝杖使战车上的福音停止工作，让战车的机能下降了不少。然后就是本章的BOSS战了，好在有尤莉亚的助阵，战车虽然hp和攻击力超高但攻击手段不多，坚持下来就是胜利。接下来凯诺娜会亲自上阵，她会不断设置定时炸弹，但只要不靠近炸弹就不会受到伤害。这一战并不算难对付。
