最终章
飞船在コロニー6临时着落，此时需要控制メリア一人单独去寻找行为变得异常的フィオルン，出城门右边走不员就能见到了，剧情后城中会响起警报，回飞船后发现有大群怪物来袭，又是ディクソン这家伙。消灭一个怪物后主角会归队，再次干掉一怪物后之前经常帮主角的阿鲁维斯出现，现出他的真实身份，灭掉第3只怪物后剧情。
巨神胎内
到了与ザンザ进行最后决战的时候来了，现在飞向巨神胎内吧！迷宫路线比较复杂，不过好在可看地图因该不至于迷路，先往东北走，再绕到西南角去经过大动脉回廊去到上层区域。进入巨神心脏后遇见3圣之1，召唤出被怪物化的メリア的皇兄，进入战斗。
监狱岛
胜利后由出现的传送前往监狱岛，此次前进的路线和第1次来时是不同的，不过此迷宫里路线非常简单，每层找到传送点上去就行了。在3F斗技场会见到ディクソン，同样需要干掉他召唤出来的怪物。胜利去追逃跑的ディクソン，要去2F厨房开个电梯到大食堂，再绕回斗技场再杀一次怪物即可去到5F大溪谷。到6F的大圣堂后走左边的楼梯上去到顶层敲响那的钟召出龙，之后回大圣堂消灭那条龙可得到龙眼，镶嵌在祭坛上便会出现通往监狱岛顶层的传送了。ディクソン正在顶层等待着大家，他化为一个巨神，打掉一定HP后会发生剧情，再彻底打败ディクソン后众人会被ザンザ带上宇宙。
这里不能查看地图，但每个行星上会有一只怪物和一绿色闪光点，走进绿色闪光点就能传送到另一行星。注意上了月球再传送就是到最终BOSSザンザ的空间了，我只能说此BOSS一共要打3次，期间神剑也会进化到第3形态……
通关后2周目重新开始游戏可继承部分装备（自选30个），部分材料，（自选60种）神剑变成最新觉醒的第3形态，人物等级羁绊值，技能等都继承，而任务什么的则不继承！
……全流程完……
